Kaplan Meier plotter能够评估54k基因(mRNA,miRNA,蛋白质)对21种癌症类型(包括乳腺癌(n=6,234),卵巢癌(n=2,190),肺癌(n=3,452)和胃癌)的存活率的影响(n=1,440)。Kaplan Meier plotter数据库的来源包括GEO,EGA和TCGA。该工具的主要目的是基于荟萃分析的生存生物标记物的发现和验证。
现在我们以“LAYN基因与乳腺癌生存率的相关性分析”为例,来演示Prognoscan的使用方法:
1.首先打开Kaplan Meier plotter地址(http://kmplot.com/analysis/
2.然后输入LAYN基因,Survival一栏选择根据条件可以选择OS、RFS、DMFS或PPS等生存因素
3.点击draw Kaplan Meier plot生成图片
4.得到含有HR和logrank P值的结果图: